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近期眾多企業接獲關務署發函的問卷，作為企業自我評量以及海關審查的用途，已有企業因未申報權利金而遭受事後稽核，並被裁定要求補稅，造成公司合規風險和財務影響。 若企業買賣合約中載明有權利金、配銷權、服務費或其他名稱的無形資產費用，依據《關稅法》第29條規定，進口人應將權利金計入貨物完稅價格向海關申報。
財政部關務署表示，依據關稅法施行細則第12條規定，以及參據WTO關稅估價協定的精神，列作進口貨物完稅價格的權利金，其支付與進口貨物有關，且為該貨物進口的交易條件。因此，不論合約中是否用權利金、配銷權、服務費或其他名稱的無形資產費用，皆需審閱是否將此類費用納入進口時的完稅價格之內，成為繳納關稅／營業稅的要素之一。
根據財政部關務署說明，國際貿易之交易狀況多元，權利金是否應計入完稅價格，須視個案而定，一般可從授權協議書或銷售合約內容加以判定，但實務上也有權利金是支付與賣方無關的第三方，且未簽訂書面合約的情形。進口人需瞭解交易條件，並依規定正確申報，即可避免因權利金而成為海關事後稽核的對象。
普華國際貿易諮詢股份有限公司經理郭維智解釋，權利金是否應納入完稅價格需多方考量，依據合約內容、銷售條件、交易關係等眾多因素多方評估，以避免違反關稅法而造成補稅或是多納付稅款。
普華商務法律事務所合夥律師李益甄說明，企業需檢視是否符合法規規定，以避免海關事後稽核而需要補稅，而造成公司合規風險和財務影響，進出口人因報單申報錯誤，涉有違反海關緝私條例情事者，只要在海關、稅捐稽徵機關或其他協助查緝機關接獲檢舉、進行調查前，主動申請更正並補繳所漏稅款，可適用海關緝私條例第45條之3規定免予額外處罰。
郭維智提醒進口人，權利金是否應加計於進口貨物完稅價格，應依關稅法之估價原則以及法律之本質，經由個案判斷並誠實申報，以免違反相關法規。
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